问题是课堂教学的波澜，也是形成课堂教学高潮的前奏。有“问题”，才有未知，也才有教学活动的展开。
在以往的教学活动中，往往是教师提问题，学生只能被动地、指向性地回答问题，这样就形成了“教师根据自然事物提问→学生思考回问→教师鉴别回问评判得出结论”的问题程序。这样的问题程序是以教师为中心设计问题、提出问题，而往往教师的提问具有指向性或单向性，学生被动地根据单一的思考点进行思考，学生的学习能力在课堂教学中很难得到充分的训练。这样的问题程序，使学生的心理状态始终处在消极的等待中。也就是说，教师没有提问时要等待教师提问，回答了教师的提问还要等待教师来鉴别回答正确与否，致使学生的思维缺乏自主性和创造性，影响了学生的思考和应有的课堂教学参与意识。
要使学生由“学会”变为“会学”，在自然教学活动中，不仅要指导学生获得一些浅显的自然科学基础知识，更要注意培养学生学科学、用科学的能力，教会他们认识周围自然界常见的事物及其相互间的联系，在认识过程中发现问题、提出问题和解决问题。在教学活动中学生是主体，教师的提问是当好向导，引好路，为启发和帮助学生提问服务。这样，自然课堂教学的“问题程序”就会改变成“学生根据材料思考提问→教师梳理主要问题→学生观察实验师生共同研讨→学生得出结论”。教师围绕学生提问，会进一步明确教学目标，展开有效的教学活动，还可及时沟通教与学之间的思维渠道。学生提问一旦活跃起来，则可以变教师的单一思考点为多元思考点，并为教师有的放矢地教，了解学生的学习难点、思维实际，捕捉认识距离，为营造主动、积极的学习群体创造条件。
新的问题程序对教师的教和学生的学都提出了更高的要求。第一，就学生学的方面看，原来被问的学生是处在消极的待问状态，现在提问的学生则是积极思维随时准备发问。学生的提问是一个复杂的心理过程，在这个过程中渗透着学生的个性，体现了学生的主动性，可以锻炼他们的观察能力、思考能力、分析问题、鉴别问题的能力，也锻炼他们的语言表达能力。学生要提问，就要求学生通过观察思考，提什么问题，怎样提问题，提的问题是否有价值等等，因此，对学生学的要求也提高了。第二，就教师教的方面看，原来是教师自己设计问题，自己有准备地解答，教师心理压力校现在是学生根据自然事物和现象，或联系日常生活实际和生产实际情况，或按照自然教材内容准备的有关实验仪器和实验现象提出问题，在某些问题上教师是无准备地解答，这就要求教师有较强的专业知识，较扎实的基础知识，较敏锐的反应问题、回答问题的应变能力。这样，教师不仅要能回答问题，还要能及时归纳出学生提问中的共性问题、典型性问题、有价值的问题，更有利于围绕教学目的、要求展开教学过程。第三，就师生关系而言，原来以教师提问为主体的教学活动使师生间的“感情交流渠”不通畅，现在是以学生多提问为主的教学活动，学生群体的积极性会得到充分调动，学生观察探究自然科学奥秘的思维方式、观点倾向都通过提问表露出来。作为教师来说，则可启发、诱导学生自己去主动探究、研讨，将他们的思索点导向科学的彼岸。在师生对问题的相互研讨、相互交流中，学生可以接受教师的观点，学生更可以保留自己观点，发展自己的观点，直到学生对问题的解释认同。这种平等、民主的学习方式必将融洽师生关系，活跃课堂教学。
